Nació en Des Moines, Iowa, EEUU, el 16 de Marzo de 1879.
Fue el médico más recordado por su dieta restringida en carbohidratos para los que sufren de diabetes mellitus.
Estudió medicina en California y fue interno de la Universidad entre 1907 y 1908.
En 1913 su padre le financia la publicación de la Enciclopedia "Glucosuria y Diabetes", de 1179 páginas.
Fue empleado en una posición mal pagada en la Universidad de Harvard, antes de trabajar en Nueva Jersey y en Boston sobre la Diabetes en 1919.
Descubrió que una reducción de la ingesta de carbohidratos, disminuye o elimina la glucosuria, la principal manifestación clínica mensurable de la diabetes en ese momento.
Esto mejoró algunas de las complicaciones de la diabetes en algunos de sus pacientes, especialmente los adultos con sobrepeso.
En ese momento, aunque los médicos reconocen diferencias en el curso y el pronóstico de la diabetes entre los pacientes jóvenes y los adultos, los tratamientos eran pocos y normalmente tratados todos por igual.
Allen abrió el Instituto Fisiátrico en Morristown, Nueva Jersey, la primera clínica en el mundo para los que sufren de la diabetes mellitus, el 26 de abril de 1921.
En 1929, abre en Rye, Nueva York y otra en la calle 57 de Midtown, Manhattan.
Elizabeth Hughes Gossett, hija de Charles Evans Hughes del Tribunal Supremo de Justicia de Estados Unidos, se mantuvo viva con las técnicas de Allen hasta que se convirtió en uno de las primeras pacientes tratadas con insulina cuando se hizo disponible como una terapia.
Antes que Frederick Banting utilice por primera vez la insulina para tratar la diabetes, en 1922, Allen estaba recomendando una dieta que podría prolongar la vida de los enfermos de diabetes mellitus, una enfermedad mortal en el momento.
Esta dieta implicó la reducción drástica de calorías, especialmente de carbohidratos, a veces con tan sólo el 8% de la ingesta de calorías procedentes de hidratos de carbono. Aunque esto podría reducir la incidencia de la glucosuria en personas con diabetes mellitus, no prolongaba la vida por más de unos pocos meses.
Como Williams y Pickup (2004) dicen: "...los avances en nuestra comprensión de la diabetes en los finales del siglo XIX no fueron acompañados de grandes avances en el tratamiento hasta el aislamiento de F. Banting de la insulina."
Allen no fue la primera persona en recomendar el tratamiento de la diabetes con dieta; como Ramachandran y Viswanathan (1998) señalan, se utilizó el tratamiento dietético de la diabetes mellitus en el antiguo Egipto, ya en 3500 antes de Cristo, y se utilizaba en la India hace unos 2.500 años.
Estos autores señalan que en el siglo XVIII, John Rollo había observado que la glucosuria en los diabéticos podría reducirse si los enfermos de diabetes mellitus bajaban la cantidad de los alimentos consumidos.
Sin embargo, Allen y sus colaboradores publicaron su trabajo de la dieta para diabéticos en 1919, en una obra titulada "Total Reglamento dietético en el tratamiento de la diabetes".
Hoy, sin embargo, los diabetólogos tienen muy diferentes puntos de vista sobre este tema a los promovidos por Allen.
De hecho, Joslin, en 1922, sugirió diferentes recomendaciones de la dieta a los de Allen, lo que sugiere una reducción de la grasa en lugar de carbohidratos, con el objetivo general de reducción de la ingesta de calorías (Hockaday, 1981).
Allen ha sido nombrado como uno de los dos principales diabetólogos, junto con Elliott P. Joslin, en el periodo 1910-1920.
Su vida termina en el Hospital Pondville del Cáncer, Massachussetts, EEUU en el año 1964.
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