Naturalista, botánico, entomólogo, herpetólogo y malacólogo alemán, nació el 8 de agosto de 1748 en Tübingen, Sacro Imperio Romano Germánico.
Hijo mayor de Philipp Friedrich Gmelin.
Estudió medicina con su padre en la Universidad de Tubinga y se licenció en medicina en 1768 con una tesis titulada: "Irritabilitatem vegetabilium, in singulis plantarum partibus exploratam ulterioribusque experimentis confirmatam", defendido bajo la presidencia de Ferdinand Christoph Oetinger, a quien agradece con las palabras "Patrono et praeceptore in aeternum pie devenerando, pro summis in Medicina obtinendis honoribus".
En 1769, Gmelin se convirtió en profesor adjunto de medicina en la Universidad de Tübingen.
En 1773 se convirtió en profesor de filosofía y profesor adjunto de medicina en la Universidad de Göttingen. Fue ascendido a profesor titular de medicina y profesor de química, botánica y mineralogía en 1778.
Murió el 1 de noviembre de 1804 (56 años) en Gotinga, electorado de Brunswick-Lüneburg.
Está enterrado en el cementerio de Alban (Cheltenham Park), en Gotinga.
Johann Friedrich Gmelin ha publicado varios libros de texto en los campos de la química, la ciencia farmacéutica, la mineralogía y la botánica.
También publicó la decimotercera edición de "Systema Naturae" de Carl Linnaeus en 1788 y 1789. Contenía descripciones y nombres científicos de muchas especies nuevas, incluidas aves que John Latham había catalogado previamente sin un nombre científico en su "Sinopsis general de aves".
La publicación de Gmelin se cita como autorizada para más de 290 especies de aves, así como para varias especies de mariposas.
Entre sus estudiantes se encontraban Georg Friedrich Hildebrandt, Carl Friedrich Kielmeyer, Friedrich Stromeyer y Wilhelm August Lampadius.
Fue el padre de Leopold Gmelin.
Describió el lucio de aleta roja en 1789.
En el campo científico de la herpetología, describió muchas especies nuevas de anfibios y reptiles.
En el campo de la malacología, describió y nombró muchas especies de gasterópodos.
Entre noventa especies y variedades llevan su nombre en su honor.
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