Médico alemán nacido en Mühlhausen, Sajonia, el 14 de mayo de 1874.
Estudió medicina en la Academia Kaiser Wilhelm de Berlín y posteriormente sirvió como médico militar en diversas funciones en las colonias alemanas de África Oriental, África Sudoccidental (1904-1906) y Kamerun (1914). Durante este período también trabajó como médico clínico en Hamburgo (1906-1913).
Durante la Primera Guerra Mundial fue higienista del cuerpo y del ejército en Bélgica, Rusia y Rumania. Después de la guerra, se retiró con el título de Generaloberst, ejerciendo la medicina en Berlín como especialista en enfermedades infecciosas.
Werner es recordado por su descripción de la fiebre de las trincheras durante un brote de la enfermedad en la Primera Guerra Mundial.
El trastorno a veces se conoce como "enfermedad de Werner-His", nombrada en conjunto con el anatomista suizo Wilhelm His, Jr. , quien también la describió.
La enfermedad es causada por el parásito Rickettsia quintana y se transmite a los humanos por el piojo del cuerpo Pediculus humanus corporis.
Durante su carrera, Werner publicó numerosos artículos sobre enfermedades tropicales y parasitarias.
Murió el 1 de enero de 1946.
* Ciencia
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