Johann-Jakob Wepfer nació en Schaffhausen, Suiza, el 23 de Diciembre de 1620.
Su padre, Georg Michael Wepfer (1591-1659), fue comerciante, magistrado y concejal en Schaffhausen.
Se graduó en el Collegium Humanitatis, la escuela secundaria de Schaffhausen.
En 1638 se matricula en la Universidad de Basilea. Entre 1639-43 obtiene en la Universidad de Estrasburgo un Bachillerato o equivalente.
En 1644, estudia en la Facultad de Medicina y Farmacia de la Universidad de Padua. También pasó una temporada en Venecia (1645) y Roma (1646). Finalmente se doctoró en Medicina en Basilea, en 1647.
De religión Calvinista (asumida) sus principales disciplinas científicas fueron la Medicina, la Anatomía y la Farmacología.
Lo que Fischer llama su obra maestra, su estudio del veneno de la cicuta (1679), era de naturaleza farmacológica. Por este trabajo, Fischer llama a Wepfer el padre de la toxicología y la farmacología experimentales.
El contenido de la obra se extiende mucho más allá de la cicuta para considerar todo tipo de plantas venenosas. Y en otros lugares llevó a cabo experimentos similares sobre venenos minerales, en los que advertía contra el uso de sustancias como el arsénico, el antimonio y el mercurio como medicamentos.
En 1648 fue nombrado médico municipal de Schaffhausen. Ejerció en todo el sur de Alemania.
Aunque Schaffhausen no tenía universidad, Wepfer tuvo numerosos estudiantes de toda Europa, entre ellos J.C. Payer y J.C. Brunner.
En 1650 fue nombrado médico del claustro de Rheinau.
Se convirtió en médico privado y asesor de diversos príncipes alemanes: en 1675, médico personal del duque de Wurttemberg y del Markgraf Friedrich de Baden-Durlach.
En 1685 fue médico personal del príncipe elector Carlos del Palatinado.
Fischer menciona al conde von Furstenburg y al abad Romanus de San Blasien.
Realizó experimentos sobre venenos con todo tipo de animales, regalos de sus pacientes de alto rango.
Perteneció a la Academia Leopoldina en 1685.
Wepfer mantuvo una correspondencia muy extensa con los principales científicos médicos del área germánica de su época.
Wepfer es recordado por su trabajo sobre la anatomía vascular del cerebro y el estudio de las enfermedades cerebrovasculares. Fue el primer médico en plantear la hipótesis de que los efectos de un derrame cerebral eran causados por un sangrado en el cerebro. También mencionó que estos síntomas podrían ser causados por un bloqueo de una de las arterias principales que suministran sangre al cerebro.
A partir de estudios post mortem, proporcionó información sobre las arterias carótidas y vertebrales que suministran sangre al cerebro.
En 1658 publicó un tratado clásico sobre los accidentes cerebrovasculares, titulado Historiae apoplecticorum.
Murió el 26 de enero de 1695.
* Ciencia

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