Nació en Stuttgart, Alemania, el 20 de octubre de 1772 y murió en Tubinga, Alemania, el 2 de mayo de 1835.
Con tan sólo 13 años asistió a conferencias sobre ciencias naturales y medicina en la Hohe Karlsschule, el predecesor de la Universidad de Tübingen.
En 1792, fue ascendido en medicina y continuó sus estudios con Antonio Scarpa y Johann Peter Frank en la famosa Universidad de Pavía.
En 1797, se convirtió en profesor de Anatomía, Fisiología, Cirugía y Ginecología en la Universidad Eberhard-Karls de Tübingen.
Más tarde, Autenrieth se convirtió en vicepresidente y rector de la universidad.
En 1805 fundó un hospital con 15 camas en 12 habitaciones lo que le permitió realizar la enseñanza al lado de la cama que fue una especie de revolución en ese momento.
Este hospital fue el primer paso en la creación de la Clínica Universitaria de Tübingen.
También fue el primero en iniciar la construcción de un Hospital Psiquiátrico [Irrenanstalt] en el que enfermos mentales al menos se intentó tratar como pacientes.
Un paciente famoso en 1806 - 1807 fue el poeta Friedrich Hölderlin.
Autenrieth se especializó en medicina forense y fue considerado uno de los mejores médicos clínicos durante la primera parte del siglo XIX.
Autenrieth se hizo conocido por su medicina de base empírica.
Fue el médico personal del rey Wilhelm I de Württemberg y miembro de muchas comisiones médicas en Württemberg.
En 1812, Autenrieth recibió la Orden del Mérito Civil.
En 1818 recibió la Cruz de Caballero de la Orden de la Corona de Württemberg, que se asoció con el título personal de nobleza.
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