Nació en Vernet (actuales Alpes marítimos), Francia, el 13 de enero de 1799.
Estudió en Paris gracias al apoyo de uno de sus tíos, médico de la Charité, Gaspard Laurent Bayle (1778-1816), uno de los creadores del pensamiento anatomo clínico.
Por influencia de su tío fue recibido por Laénnec.
Pasó a trabajar como interno en el Manicomio de Charenton (París), en el Servicio de Royer-Collard.
Posteriormente se convirtió en profesor asociado y bibliotecario adjunto de la Faculté de Médecine de Paris. Renunció a este cargo en 1834 y abrió una práctica privada.
Bayle pasó a la historia por la descripción de la Demencia paralítica como debida a inflamación de las meninges, con lo que se introduce en Psiquiatría la tesis anatomoclínica, que publicó en su famosa Recherches sur les maladies mentales (1822).
Durante un tiempo había predominado en relación con la Demencia paralítica, la tesis dualista de Esquirol y Baillarger, que entendían que había dos formas, la Demencia paralítica y el Delirio paralítico.
Bayle mostró que ambas formas se debían a la misma enfermedad.
El hecho de que dos discípulos de Esquirol, Delaye y Achille Foville, hubieran señalado que ellos habían sido los primeros en mostrar el origen inflamatorio de las meninges de la Paralisis General, llevó a Bayle a ocuparse de nuevo de la enfermedad para defender sus planteamientos originales.
En 1824 fundó la revista Revue médicale y de 1828 a 1837 fue editor de la Bibliothèque de thérapeutique (Biblioteca de Terapéutica ) de varios volúmenes.
En 1825 publicó Nouvelles doctrines des maladies mentales, en donde analizó especialmente el deliro de grandeza (delirio ambicioso) de estos pacientes, un hecho que situó como el central del cuadro clínico.
Al año siguiente (1826) publicó, Traité des madies du cerveau, y en el sugiere que la mayoría de las enfermedades mentales se deben a flegmasía crónica primitiva de las membranas del cerebro.
Bayle en 1854 presentó en la Academia de Medicina una Memoria dedicada a sus observaciones sobre la Paralisis General, mostrando que esta enfermedad se debía a una lesión inflamatoria de las meninges y que toda la sintomatología, Demencial, Delirante y Paralitica, dependía de ello.
La importancia de este trabajo reside, aparte de caracterizar la enfermedad y aclarar su etiología, en que significó la introducción de la mentalidad anatomoclinica en Psiquiatría.
La investigación posterior se caracterizó por la búsqueda de las lesiones especificas en la enfermedad mental que dio sus mejores frutos en la caracterización de las Demencias que fueron aislándose, precisamente por su lesión: Anatomopatológica (Klippel), Parenquimatosa (Azheimer), etc Posteriormente se sospechó el origen luético de la enfermedad, a partir especialmente de las observaciones de Fournier (1879), habiendo demostrado este origen, en 1913, Nogouchi y Jahnel al observar espiroquetas en el cerebro de estos enfermos, con lo que quedó establecida claramente la etiología de la Parálisis General Progresiva.
Murió el 29 de marzo de 1858.

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