Nació el 29 de marzo de 1853 en Ambaza, departamento de Haute-Vienne; murió el 17 de marzo de 1916 en París.
Estudió en Limoges.
Al terminar la Guerra de 1870 se trasladó a París y en 1875 fue nombrado interno hospitalario, pasando a ser jefe de Clínica de Jean-Martin Charcot, con quien fue fundador de la clínica en el Hospital de la Pitié-Salpêtrière.
Fue uno de los primeros en mantener una etiología sifilítica de parálisis.
Como historiador, escribió biografías sobre el místico, filósofo y teólogo cristiano Emanuel Sweden Borg (1688-1772), sobre Leonardo da Vinci (1452-1519) y Marie Leszczynka (1703-1768), reina consorte del rey Luis XV de Francia (gobernó de 1715 a 1774).
En 1884 es médico de los Hospitales y Académico de Medicina en 1912.
En 1904 creó el servicio de psiquiatría del Hôtel-Dieu en París y en 1907 fue nombrado profesor de historia de la medicina en la Facultad de Medicina de París.
En 1909 ocupa la cátedra muy codiciada de clínica de las enfermedades mentales y del encéfalo en el hospital Sainte-Anne. El mismo año fue elegido presidente de la Sociedad Francesa de Historia de la Medicina.
Al morir Joffroy fue nombrado en 1909 titular de la Cátedra de Psiquiatría, habiendo desempeñado con anterioridad la Cátedra de Historia de la Medicina.
Publicó sobre temas de Neurología, Psiquiatría e Historia.
Fue cofundador de la Sociedad Médico-psicológica.
Su nombre queda ligado básicamente a la Psicosis alucinatoria crónica, un cuadro que defendió apasionadamente y que seguramente significó la defensa de la psiquiatría francesa frente a la alemana de Kraepelin que empezaba a ser asimilada en este país.
Él es quien describe y define la esquizofrenia paranoide en 1911.
"Gilbert-Ballet" se refiere a este cuadro en 1911, que había sido descrito previamente por Seglas (1908) y por Dide y Grasset (1910) y solo lo analizó basándose en la experiencia de otros autores ya que él no aportó nuevos casos, pero su nombre quedó ligado a este trastorno por el énfasis puesto en la defensa de su independencia clínica.
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